Wenn du einfach nur das originale Repo clonen willst um damit zu arbeiten, dann erstell dir einen lokalen Branch und merge da bei Änderungen den Master rein.
ODER
Erstell dir auf Github eine Fork. Das ist dann quasi deine eigene Kopie des Repositories unter deinem Account. Dort kannst du dann einen Branch für deine Änderungen erstellen.
Wenn später das original Repo neue Commits hat, kannst du die in deinen Fork pullen. Danach dann den Master Branch auf deinen Branch mergen.
Das sind nur Beispiele. Git hat so viele Möglichkeiten 